Изучение мутационного профиля опухоли для подбора таргетной терапии

Аннотация

Актуальность. В настоящее время лечение онкологических больных основано на персонализированном подборе лекарственных препаратов в зависимости от мутационного статуса опухоли, который направлен на уточнение прогноза заболевания и предсказание ответа на лечение. Цель исследования. Провести поиск мутаций в тканях опухоли, фиксированные парафином, с целью оптимизации назначения таргетного лечения. Материалы и методы исследования. Материалом исследования явились парафиновые блоки с биопсийным/операционным материалом пациентов. ДНК и РНК были извлечены с использованием набора RecoverAll™ Multi-Sample RNA/DNA (Termofisher Scientific, США) в соответствии с инструкциями произ водителя. Применялся молекулярно-генетический метод – NGS-технология с использованием таргетного полупроводникового секвенирования (Ion Gene Studio S5 Plus (Termofisher Scientific, США). Подготовка библиотеки ДНК и РНК с последующим секвенированием амплифицированных фрагментов производилась в системе Ion PGM™. Биоинформационный анализ результатов осуществлялся с помощью программного обеспечения Ion Reporter™ Software, модуля анализа Oncomine™ Focus Assay. Результаты исследования. В результате исследования в 95 % случаях при солидных опухолях различной локализации были выявлены изменения генома. В 80 % случаях идентифицированы миссенс-мутации [BRAF; KRAS; IDH1; PIK3CA]. У 20 % пациентов выявлены сочетания двух мутаций [PIK3CA, FGFR3; PIK3CA, KRAS; EGFR, JAK3; BRAF, KRAS; ALK-PIK3R1; CDKN2-,IDH2; TP53, JAK2; ROS1, FGFR1]. В 10 % случаев обнаружено увеличение числа копий генов EGFR и KRAS, и в 10 % случаев – слияние гена (РНК) MET- MET.М13М15; TMPRSS2-ERG. У 5 % пациентов обнаружено более 5 мутаций, данный факт отмечался у пациентов старшей возрастной группы и быстрым развитием метастазов. Идентифицированные изменения генома обрабатывались сервером через реестры FDA, NCCN, EMA, ESMO для поиска наиболее подходящих вариантов терапии, существующих в мировой практике при конкретном виде и локализации установленной мутации. Заключение. Мутационный профиль опухоли является необходимым лабораторным тестом в практике врача-химиотерапевта для персонифицированного назначения таргетных препаратов, что благоприятно сказывается на продолжительности и качестве жизни.

Об авторах

Список литературы